Bordeaux et AJ Auxerre se sont affrontés 67 fois, de 1980/1981 à 2023/2024 : 31 victoires bordelaises, 17 nuls et 19 défaites, 90 buts marqués et 62 encaissés.
Plus large victoire : Girondins de Bordeaux 6-1 AJ Auxerre (Division 1, 22 mars 1985). Plus lourde défaite : AJ Auxerre 5-0 Girondins de Bordeaux (Ligue 1, 31 janvier 2004). Dernière confrontation : AJ Auxerre 3-1 Girondins de Bordeaux (Ligue 2, 15 janvier 2024). Meilleur buteur bordelais face à AJ Auxerre : Bernard Lacombe (10 buts).