Bordeaux et Bayern Munich se sont affrontés 4 fois, de 1995/1996 à 2009/2010 : 2 victoires bordelaises, 0 nul et 2 défaites, 5 buts marqués et 6 encaissés.
Plus large victoire : Bayern Munich 0-2 Girondins de Bordeaux (Ligue des champions, 3 novembre 2009). Plus lourde défaite : Bayern Munich 2-0 Girondins de Bordeaux (Coupe de l'UEFA, 1er mai 1996). Dernière confrontation : Bayern Munich 0-2 Girondins de Bordeaux (Ligue des champions, 3 novembre 2009). Meilleur buteur bordelais face à Bayern Munich : Daniel Dutuel (1 but).