Bordeaux et FC Annecy se sont affrontés 6 fois, de 1991/1992 à 2023/2024 : 3 victoires bordelaises, 0 nul et 3 défaites, 7 buts marqués et 8 encaissés.
Plus large victoire : Girondins de Bordeaux 3-1 FC Annecy (Ligue 2, 11 novembre 2023). Plus lourde défaite : FC Annecy 2-0 Girondins de Bordeaux (Division 2, 8 février 1992). Dernière confrontation : FC Annecy 3-1 Girondins de Bordeaux (Ligue 2, 16 mars 2024). Meilleur buteur bordelais face à FC Annecy : Zan Vipotnik (2 buts).