Bordeaux et RC Franc-Comtois se sont affrontés 1 fois, en 1961/1962 : 0 victoire bordelaise, 0 nul et 1 défaite, 1 but marqués et 3 encaissés.
Plus lourde défaite : RC Franc-Comtois 3-1 Girondins de Bordeaux (Division 2, 11 octobre 1961). Dernière confrontation : RC Franc-Comtois 3-1 Girondins de Bordeaux (Division 2, 11 octobre 1961). Meilleur buteur bordelais face à RC Franc-Comtois : Zahar Brahim (1 but).