Elie Baup a entraîné les Girondins de Bordeaux du 6 janvier 1998 au 18 octobre 2003.
Bilan : 274 matchs, 134 victoires, 66 nuls et 74 défaites.
Palmarès sur le banc bordelais : Champion de France (1998/1999) et Coupe de la Ligue (2001/2002).