En 1999/2000, les Girondins de Bordeaux disputent 54 matchs officiels : Division 1 (4e sur 18), Coupe de France (1/2 de finale), Coupe de la Ligue (1/8 de finale), Trophée des champions (Finale) et Ligue des champions. Bilan : 23 victoires, 14 nuls et 17 défaites, 75 buts marqués et 65 encaissés.
Meilleur buteur : Lilian Laslandes (19 buts), devant Sylvain Wiltord (17) et Johan Micoud (9). 24 joueurs utilisés, le plus présent étant Ulrich Rame (53 matchs). Plus large victoire : Girondins de Bordeaux 4-0 Troyes AF (Division 1, 14 août 1999).